Nous sommes en 1878, à Tokyo, an 11 de l’ère Meiji. Le Japon sort d’une terrible guerre civile qui a vu la victoire des patiotes
et la fin du Shôgunat et de l’ère Edo qui a duré plus de 300 ans. L’un des artisans de cette victoire fut Kenshin Himura, dit « Battosaï », un expert en
sabre qui a agi en tant qu’assassin pour le compte des patriotes. A la fin de la guerre, il part en errance à travers le pays, jusqu'à trouver refuge au dojo Kamiya, chez Kaoru, où il
est rejoint par Sanosuke, un jeune combattant, et Yahiko, jeune élève de Kaoru.
Alors qu'il pense pouvoir vivre en paix, Kenshin voit son passé le rattraper. Enishi Yukishiro, avec 5 complices, s'en prend à lui pour venger le meurtre de sa soeur Tomoe, l'ancienne femme d'Himura.
Ils arrivent en montgolfière. Kujiranami est le premier à se lancer à l'assaut du dojo, mais il est rapidement contré par Kenshin et Sanosuke. C'est alors Banjin et Otawa qui attaquent. Banjin domine Sanosuke, même si ce dernier résiste, tandis que Kenshin bloque Otawa, pour protéger les autres. Gé'in intervient alors, avec son Iwanbo, modèle n°3, bien plus terrifiant qu'avant.
Kenshin doit s'occuper d'Iwambo, et remet le combat contre Otawa entre les mains de Yahiko. L'affrontement contre la marionnette géante s'avère difficile pour Kenshin. Faite d'une matière absorbant les coups, et disposant de mécanismes lui permettant de réaliser des attaques inhumaines, Iwanbo est un adversaire hors norme. Kenshin n'arrive pas à prendre l'avantage. Toutefois, il parvient finalement à briser un bras d'Iwanbo. Gé'in contre-attaque et blesse Kenshin. Ce dernier pare le coup suivant en utilisant le bras coupé comme d'un bouclier. Il trouve enfin la solution en réalisant un tsuki, une technique d'estoc, pour percer le corps de la marionnette. Alors que tout le monde croit qu'il vise Gé'in à l'intérieur d'Iwanbo, Kenshin s'en sert pour introduire une pierre dans le corps de la machine, et bloquer ses engrenages. Incapable de bouger, Gé'in est vaincu. Himura met définitivement fin au combat en utilisant le Dragon Divin.
Enishi reste dans son ballon, il ne descendra qu'une fois que tous les autres auront été vaincus. Kenshin en profite pour se reposer et se soigner. Cependant, il est toujours rongé par la culpabilité, et le fait que ses crimes mettent aujourd'hui en danger ceux qui lui sont chers.
Le combat reprend entre Banjin et Sanosuke. Avec ses carapaces, Banjin bloque les coups de Sano, et utilise l'école de l'invincibilité pour attaquer. Avec une technique surpuissante, il pense le terrasser. Mais une fois encore, Sanosuke se relève, quoique sonné. Banjin, sûr de lui, demande à Sanosuke d'utiliser sa technique du double coup, qui avait brisé ses précédentes carapaces. Malgré les mises en garde de Megumi, il s'exécute. Sous le choc, son poing se disloque, mais il brise les deux protections de son adversaire, ainsi que ses bras. D'un dernier coup de tête, Sanosuke assomme Banjin.
Pendant ce temps, Otawa et Yahiko s'affrontent. Otawa recourt au sabre Bishamon. Cependant son style de combat est approximatif. Yahiko s'enhardit et s'expose. Otawa l'asperge alors d'une poudre spéciale, la poudre Bishamon. Selon Otawa, associée à son sabre, elle peut transformer un parfait débutant en maître. Et c'est ce qui se passe. Otawa devient plus rapide, plus précis, et il parvient à toucher plusieurs fois Yahiko. Kaoru comprend l'astuce. Le sabre est chargé en magnétisme, et la poudre est de la limaille d'acier, qui attire le sabre. Yahiko trouve alors le moyen de renverser la situation. Il feint d'attaquer pour subtiliser le fourreau à Otawa. Celui-ci, garni d'aimants, attire le sabre bien plus efficacement que la poudre. Yahiko parvient ainsi à bloquer l'attaque d'Otawa. Il pense alors avoir gagné, et s'apprête à porter le dernier coup, mais son adversaire utilise alors sa plus grande arme secrète : le Rikudoko. C'est un ensemble de pointes extrêmement longuertie du costume d'Otawa, et qui transpercent Yahiko.
Kenshin s'apprête à prendre la relève, mais Yahiko, bien que grièvement touché, se relève et insiste pour terminer ce combat. Otawa décide de l'achever avec un sabre de débutant. Il l'attaque, mais Yahiko bloque l'attaque avec le Hadome, et contre-attaque avec le Hawatari, l'arcane suprême de l'école Kamiya. Otawa s'écroule, vaincu. Yahiko, blessé et épuisé, s'effondre à son tour.
C'est au tour du dernier compagnon d'Enishi d'attaquer. Il attaque par surprise Kaoru, mais Kenshin la sauve in extremis. Yatsume est leur dernier adversaire. Il veut tuer Kenshin car il est le seul à avoir vu son visage. Ses membres, et notamment son bras gauche, sont d'une taille gigantesque. C'est l'héritage de son clan, qui se servait de cette technique d'étirement des membres pour adapter leur corps au travail des mines.
Au même moment, à l'entrée du dojo, Saito vient de réapparaître, surprenant Megumi et Sano...
Beaucoup d'action dans ce tome. Pour la première fois, Yahiko se bat aux côtés de Kenshin. Chaque combattant est poussé dans ses limites, sauf Kenshin, mais on devine déjà que l'affrontement avec Enishi sera le point d'orgue de cette bataille. Les doutes d'Himura laissent également percevoir que, d'une façon ou d'une autre, ce combat sera un tournant décisif pour la suite de l'histoire, car il ne s'agit pas simplement de stopper un homme dangereux, comme c'était le cas avec Shishio ; Kenhin doit également répondre des crimes qu'il a commis, tout en protégeant ses amis. Un problème épineux dont il devra trouver la solution...